Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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DysfQ9ESD7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DysfQ9ESD7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms