Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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