Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms