Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp2aQ9DB34 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp2aQ9DB34 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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