Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf4Q9DAW6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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