Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Subh2bvQ9D9Z7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Subh2bvQ9D9Z7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Subh2bvQ9D9Z7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Subh2bvQ9D9Z7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Subh2bvQ9D9Z7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Subh2bvQ9D9Z7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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