Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Gtf3c6Q9D8P7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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