Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms