Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klhl40Q9D783 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms