Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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MsraQ9D6Y7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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MsraQ9D6Y7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MsraQ9D6Y7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MsraQ9D6Y7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MsraQ9D6Y7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MsraQ9D6Y7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MsraQ9D6Y7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MsraQ9D6Y7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsraQ9D6Y7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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MsraQ9D6Y7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MsraQ9D6Y7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MsraQ9D6Y7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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MsraQ9D6Y7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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MsraQ9D6Y7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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