Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms