Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms