Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr42e1Q9D665 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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