Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap53Q9D439 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms