Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fndc8Q9D2H8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fndc8Q9D2H8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms