Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hddc3Q9D114 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms