Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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