Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ddx56Q9D0R4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ddx56Q9D0R4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ddx56Q9D0R4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ddx56Q9D0R4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ddx56Q9D0R4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ddx56Q9D0R4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ddx56Q9D0R4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ddx56Q9D0R4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ddx56Q9D0R4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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