Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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