Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18aQ9CZJ6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms