Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms