Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Xrcc3Q9CXE6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms