Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms