Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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