Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sppl3Q9CUS9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl3Q9CUS9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl3Q9CUS9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl3Q9CUS9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl3Q9CUS9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl3Q9CUS9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl3Q9CUS9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sppl3Q9CUS9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms