Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ykt6Q9CQW1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ykt6Q9CQW1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ykt6Q9CQW1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ykt6Q9CQW1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms