Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms