Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms