Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Q9CQC3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CQC3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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