Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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