Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms