Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms