Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms