Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntnap2Q9CPW0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap2Q9CPW0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms