Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms