Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Hdac9Q99N13 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Hdac9Q99N13 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Hdac9Q99N13 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Hdac9Q99N13 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Hdac9Q99N13 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Hdac9Q99N13 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Hdac9Q99N13 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Hdac9Q99N13 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms