Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms