Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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