Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab28Q99KL7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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