Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg8Q8VE18 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Smg8Q8VE18 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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