Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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