Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casc3Q8K3W3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms