Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ndufs8Q8K3J1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms