Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MyripQ8K3I4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms