Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sash3Q8K352 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms