Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms