Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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