Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms