Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

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Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tshz3Q8CGV9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms