Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Brf1Q8CFK2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Brf1Q8CFK2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Brf1Q8CFK2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Brf1Q8CFK2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brf1Q8CFK2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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